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已知一段序列要建立系统发育树通过blast怎样查询相似度最高菌种的标准菌株。求帮忙。


来源:澳门葡京      发布时间:2019-11-13 08:33     点击率:

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  第三步:出现下面页面,在框框里输入你的序列,下面有选项(老鼠的,人的,其他的),根据情况自己选择一个。

  到这一步我是清楚的,我想问的是,进一步怎么获得标准菌株,就是点后面的genbank序列号,怎么获得标准菌株?

  不是,建立系统发育树,要求用标准菌株,也就是模式菌株,不知道从那些相似菌株中怎么选择。

  我们一般都是从上往下选择最上面的,上面的相似度最高,还有就是看文献,文献中报道过的菌株也可以用作参考来构建进化树。

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