微生物菌株鉴定构建发育树的问题
一般来说，按照相似性高地排列下来，选择靠前的几个属的菌。比如说你的比对结果为最相似的菌前10个都是A这个属的，那么你的菌一般来说跑不出这个属；再往下的第二个属可以作为外属，就是说系统发育树不仅要有你的菌所在的属，还得有一个和它最相近的另一个属。确定属之后，找到这个属的所有的菌，将他们的序列都用上来建树。最理想的树建出来的结果是16S最相近的菌和你的菌在一支上，并且进化距离也最短。
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